Président : Bernard CHALMOND (CMLA, ENS Cachan)
Secrétaire : Philippe BASTIEN (L'OREAL)
Trésorier : Philippe COURCOUX (ENITIAA, Nantes)
Objectifs
- présenter des réalisations effectives et partager des expériences,
- recenser un certain nombre de besoins identifiés ou émergeants,
- sensibiliser celles et ceux confrontés aux données images,
- promouvoir et expliquer les méthodes et leur potentiel,
- aborder la validation des méthodes.
Les données de type « image » constituent d’immenses réservoirs d’information qui souvent sont sous employés dans le sens où ils cachent des informations clefs inaccessibles de visu.
Ces images sont issues d’instruments de mesures très variés et le plus souvent spécifiques de domaines d’expertise : microscopie (large champ, confocal, fluorescence,…), épiluminescence, puce ADN, spectroscopie de masse (MS/MS, LC/MS), OCT (Optical Coherence Tomography), échographie US, radiographie rayon X, IRM (DCE-MRI), imagerie multispectrale, hyper spectrale …
Le groupe AQS s’adresse aux domaines d’expertise touchant aux sciences du vivant, à la pharmacie, la santé, l’agro-industrie.
Illustrons par un exemple concret la problématique qui est la notre. Supposons que l’on souhaite mettre en évidence un éventuel changement sur une structure biologique entre deux instants, et ceci sur la base d’images observées en ces instants. Les différences peuvent être très légères et même indiscernables à l’oeil, de plus, les fluctuations d’une expérience à l’autre sont importantes. L’approche statistique s’impose donc. Mais quelles sont les variables caractéristiques pertinentes contenues dans les images qui peuvent entrer dans la composition du modèle statistique ? Ici, deux domaines de compétences interfèrent : celui de l’analyse des images et celui de la décision statistique. En fait dans de nombreuses situations, il est difficile de séparer le travail entre d’une part celui du traiteur d’image et d’autre part celui du statisticien. Il faut aborder la construction de la procédure de décision comme un tout. Cela signifie en particulier que le choix et l’extraction des caractéristiques d’images procèdent aussi d’une sensibilité statistique.
Activités
Le groupe AQS a organisé la journée "
Données images et prédiction statistique en sciences du vivant" le 9 juin 2008, à l'IHP.
La prochaine journée de travail concernera le thème "
Protéomique et statistique", le 24 octobre 2008 au CEA-LETI-MINATEC de Grenoble.
Contact
Bernard.Chalmond@cmla.ens-cachan.fr